Iestāde apsaimnieko kapsētas, uztur tās kārtībā un rūpējas par labiekārtošanu, veic kapsētu mākslas un kultūrvēsturisko pieminekļu, kā arī pasaules karos un represijās bojā gājušo piemiņas vietu uzraudzību. Šobrīd atvērtas kapsētas statuss ir tikai Meža kapsētai, kur iespējams ierīkot jaunas ģimenes kapavietas. Daļēji slēgtas un apbedījumi tiek veikti jau esošajās kapavietās Bērzu kapsētā, Baložu kapsētā, Zanderu kapsētā, Miera kapsētā, Romas kapsētā, Kalnakroga kapsētā un Norauku kapsētā. Staļplača kapsēta ir slēgta jauniem apbedījumiem.
Tā kā Otrā pasaules kara laikā pilsētas arhīvu materiāli ir iznīcināti, mirušo reģistrācija atsākta 1955. gadā. Tiek veikti ieraksti speciālās kapu grāmatās, kur no 1971. gada norādīta arī kapa vietas atbildīgā persona. No 1999. gada 1. jūlija tika slēgti Kapavietas uzturēšanas līgumi. Ar 2021. gada 6. jūliju stājās spēkā Jelgavas valstspilsētas pašvaldības saistošie noteikumi Nr. 21-12 “Jelgavas pilsētas pašvaldības kapsētu darbības un uzturēšanas noteikumi”. Saistošo noteikumu būtiskās izmaiņas nosaka kapsētu iekšējās kārtības noteikumus, kapavietu piešķiršanas, kopšanas un uzturēšanas kārtību, apbedīšanas kārtību, kapliču izmantošanas kārtību, kapsētu apsaimniekotāja un kapavietas uzturētāju tiesības un pienākumus, kā arī paredz administratīvo atbildību par saistošo noteikumu neievērošanu. Būtiskākā atšķirība no iepriekšējiem noteikumiem ir tāda, ka vairs netiks slēgti kapavietas uzturēšanas līgumi. Turpmāk kapavietas uzturēšanas tiesības tiks piešķirtas uz administratīvā akta pamata, ko vienas darba dienas laikā no iesnieguma saņemšanas dienas pieņems kapsētu apsaimniekotājs – Jelgavas valstspilsētas pašvaldības iestāde “Pilsētsaimniecība”. Iestādes pieņemtos administratīvos aktus varēs apstrīdēt domes priekšsēdētājam, savukārt domes priekšsēdētāja lēmumus Administratīvā procesa likumā noteiktajā kārtībā varēs pārsūdzēt Administratīvajā rajona tiesā. Kapavietas uzturēšanas tiesības, kuras ir piešķirtas saskaņā ar iepriekš noslēgtajiem kapavietas uzturēšanas līgumiem, paliks spēkā.